1. Repositorio UEM
  2. Centro de Biotecnologia - CB
  3. Dissertações de Mestrado - CB
Please use this identifier to cite or link to this item: http://www.repositorio.uem.mz/handle258/790
Full metadata record
DC FieldValueLanguage
dc.contributor.advisorSacarlal, Jahit-
dc.contributor.advisorTaviani, Elisa-
dc.contributor.advisorVítor, Jorge Manuel Barreto-
dc.contributor.advisorVale, Ana Filipa Ferreira do-
dc.contributor.authorMajaliwa, Nashon Dussin-
dc.date.accessioned2023-06-21T13:09:55Z-
dc.date.issued2022-07-01-
dc.identifier.urihttp://www.repositorio.uem.mz/handle258/790-
dc.description.abstractBackground: Helicobacter pylori (H. pylori) is a human pathogenic bacterium responsible for a variety of gastric diseases, including dyspepsia. The global prevalence of its infection is approximately 50%, but can reach 90% in developing countries, such as those in sub-Saharan Africa, where Mozambique is included. H. pylori strains show a high level of genotypic diversity and express several genes that contribute to their pathogenicity and resistance. In Mozambique, there is lack of information on H. pylori infection, its resistance to antibiotics, its virulence factors, and its phylogeny. Therefore, we aimed to investigate the occurrence of H. pylori infection and its genomic characterization in dyspeptic patients seen at the Department of Gastroenterology, Hospital Central de Maputo, in Mozambique. Methodology: This is a cross-sectional descriptive study conducted between June 2017 and June 2020, in which 171 dyspeptic patients were recruited, and through Upper GI endoscopy, gastric biopsies were collected from those patients. To perform molecular analysis, bacterial genomic DNA was directly extracted from gastric biopsies, and PCR was performed for the detection of H. pylori and its resistance mechanisms to clarithromycin (23S rRNA), fluoroquinolones (gyrA) and metronidazole (rdxA) and, mutations conferring resistance to these antibiotics were investigated by sequencing these genes (23S rRNA, gyrA and rdxA). Additionally, virulence genes (vacA, dupA and cagA) were detected, and MLST typing was also performed for the phylogenetic characterization of H. pylori strains infecting patients Results: Of the 171 samples tested, H. pylori was detected in 56.1% (96/171). The clarithromycin resistance rate was 10.4% (the responsible mutations were: A2141G and A2142G), the fluoroquinolones resistance rate was 20% (the responsible mutations were: N87I and D91G) and, the metronidazole resistance rate was 55.2% (4 types of mutations responsible for metronidazole resistance were identified which include, D59N, R90K, H97T and A118T. However, in many cases, they appeared in combination, with D59N+R90K+A118T being the most frequent combination). Regarding virulence genes, vacA was detected in all samples (100%), dupA in 61.5% and cagA was detected only in 16.7% of samples and, among the combinations of vacA genotype, vacA s1/m2 was the most frequent. Characterization of phosphorylation sites in cagA- positive samples revealed that 93.8% were EPIYA-ABC and only 6.2% were EPIYA-ABCCC. Based on MLST typing, a diversity was found among H. pylori strains infecting patients and, they were classified as hpAfrica2 (50%), hpAfrica1 (33.3%) and hpEurope (16.7%). Conclusion: More than half of the dyspeptic patients seen at the Department of Gastroenterology, Hospital Central de Maputo, are infected with H. pylori strains resistant to metronidazole and fluoroquinolones. However, their virulence factors suggest moderate virulence of these strainsen_US
dc.language.isoporen_US
dc.publisherUniversidade Eduardo Mondlaneen_US
dc.rightsopenAcessen_US
dc.subjectHelicobacter pylorien_US
dc.subjectDoenças gástricasen_US
dc.subjectDispepsiaen_US
dc.subjectResistência a antibióticosen_US
dc.subjectDyspepsiaen_US
dc.subjectGastric diseasesen_US
dc.subjectAntibiotic resistanceen_US
dc.titleDetecção molecular e genotipagem de Helicobacter Pylori em pacientes dispépticos atendidos no Hospital Central de Maputoen_US
dc.typethesisen_US
dc.description.embargo2023-06-21-
dc.description.resumoIntrodução: Helicobacter pylori (H. pylori) é uma bactéria patogénica humana responsável por uma variedade de doenças gástricas, incluindo a dispepsia. A prevalência global da sua infecção é de aproximadamente 50%, mas pode chegar aos 90% nos países em desenvolvimento, como os da África subsaariana, de que Moçambique faz parte. As estirpes de H. pylori apresentam um elevado nível de diversidade genotípica e expressam vários genes que contribuem para a sua patogenicidade e resistência. Em Moçambique, há escassa informação sobre infecção por H. pylori, sua resistência aos antibióticos, seus factores de virulência e sua filogenia. Assim sendo, o nosso objectivo foi de investigar a ocorrência de infecção por H. pylori, e a sua caracterização genómica em pacientes dispépticos atendidos no Serviço de Gastroenterologia, do Hospital Central de Maputo, em Moçambique. Metodologia: Trata-se de um estudo descritivo transversal realizado entre Junho de 2017 e Junho de 2020, em que foram estudados 171 pacientes dispépticos, e através da Endoscopia Digestiva Alta foram colhidas biópsias gástricas. Para a realização de análise molecular, o DNA genómico bacteriano foi directamente extraído das biópsias, e foi feito PCR para a detecção de H. pylori e seus mecanismos de resistência à claritromicina (23S rRNA), às fuoroquinolonas (gyrA) e ao metronidazol (rdxA) e, as mutações que conferem resistência a esses antibióticos foram investigadas através da sequenciação desses genes (23S rRNA, gyrA e rdxA). Adicionalmente, foram detectados os genes de virulência (vacA, dupA e cagA), e também foi realizada a tipificação por MLST para a caracterização filogenética das estirpes de H. pylori que infectam os pacientes. Resultados: Das 171 amostras testadas, H. pylori foi detectado em 56,1% (96/171). A taxa de resistência à claritromicina foi de 10,4% (as mutações responsáveis foram: A2141G e A2142G), a taxa de resistência às fluoroquinolonas foi de 20% (as mutações responsáveis foram: N87I e D91G) e, a taxa de resistência ao metronidazol foi de 55,2% (foram identificados 4 tipos de mutações responsáveis por resistência ao metronidazol que incluem, D59N, R90K, H97Te A118T, contudo, elas apareciam combinadas em muitos casos, tendo sido D59N+R90K+A118T a combinação mais frequente). Relativamente aos genes de virulência, vacA foi detectado emvtodas as amostras (100%), dupA em 61,5% e cagA foi detectado apenas em 16,7% das amostras e, entre as combinações do genótipo vacA, vacA s1/m2 é que foi a mais frequente. A caracterização de locais de fosforilação em amostras cagA-positivas revelou que 93,8% eram do EPIYA-ABC e apenas 6,2% é que era EPIYA-ABCCC. Com base na tipagem por MLST, foi verificada uma diversidade entre as estirpes de H. pylori que infectam os pacientes e, foram classificadas em: 50% hpAfrica2 (50%), hpAfrica1 (33,3%) e hpEurope (16,7%). Conclusão: Mais de metade dos pacientes dispépticos atendidos no Serviço de Gastroenterologia, do Hospital Central de Maputo, estão infectados com estirpes de H. pylori resistentes ao metronidazol e às fluoroquinolonas; isso compromete a segunda linha de tratamento, podendo ocasionar aumento da falência terapêutica nesses pacientes. No entanto, os seus factores de virulência sugerem uma virulência moderada dessas estirpesen_US
Appears in Collections:Dissertações de Mestrado - CB

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
2022 - Majaliwa, Nashon Dussin.pdf2.71 MBAdobe PDFView/Open
Show simple item record


Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.